Saefudin Noer merupakan alumnus Universitas Indonesia terkhususnya Departemen Ilmu Administrasi pada program sarjana tahun 1992. Beliau juga menamatkan pendidikan magister di Manajemen Komunikasi dan mengenyam pendidikan di luar negeri salah satunya di Belanda dengan studi Port Management UNESCO-IHE. Program pendidikan lainnya yang ditempuh adalah INSEAD Leadership Program Singapore and Fountaine Bleau, France, Post Master Scholarship Program From CIMB Group, dan INSEAD Business School CIMB.

Kiprahnya di sektor bisnis Indonesia dimulai di perusahaan IMPAC tahun 1993, selanjutnya berpindah ke dunia perbankan yang diawali dengan merger Bank Tako Over (BTO) yang saat ini menjadi Bank Danamon. U. Saefudin Noer juga merambah ke sektor perbankan Syariah dengan jabatannya sebagai Business Director di Bank Mualamat Indonesia tahun 2005-2000, selanjutnya diamanahkan menjadi pimpinan Bank CIMB Niaga Syariah pada 2009-2014. Saat ini beliau menjabat sebagai Direktur Utama PT. Pelabuhan Indonesia III (Persero) melalui Keputusan Menteri BUMN Nomor SK-209/MBU/06/2020.